Минфин России в письме от 05.03.2014 № 03-07-15/9519 разъяснил, что в соответствии с п. 3 Правил заполнения счета-фактуры, утвержденных постановлением Правительства Российской Федерации от 26.12.2011 № 1137, стоимостные показатели счета-фактуры указываются
в рублях и копейках без округления, предусмотренного
п. 6 ст. 52 Налогового кодекса российской Федерации.

Соответствующие разъяснения доведены письмом
ФНС России от 04.04.2014 № ГД-4-3/6155@.

С документами Федеральной налоговой службы по вопросу исчисления НДС можно ознакомиться с помощью
Интернет-сервиса «Разъяснения ФНС, обязательные для применения налоговыми органами» на сайте www.nalog.ru.